Почему вымер тонкоклювый кроншнеп?

В начале апреля 2019 года в журнале Mitochondrial DNA российскими учеными была опубликована полная последовательность митохондриальной ДНК вымершего в начале текущего тысячелетия тонкоклювого кроншнепа. Этот шаг предвосхищает начало длинного пути, итогом которого станет понимание того, какими были главные причины и временные рамки катастрофического сокращения численности этого вида, приведшего его к окончательной гибели.

В последние годы коллекции музейных биологических образцов привлекают повышенное внимание исследователей с точки зрения анализа ДНК.  Благодаря значительному развитию методов молекулярной биологии, которые позволяют экстрагировать генетический материал из самых разнообразных биологических объектов, удешевлению технологий определения последовательности геномов (секвенирование ДНК), а также упрощению их математической обработки, появляется прекрасная возможность заглянуть в прошлое нашей планеты и узнать много нового об организмах, некогда населявших её.

Тонкоклювый кроншнеп. Иллюстрация: The Birds of Europe, 1830

Тонкоклювый кроншнеп (Numenius tenuirostris) относится к существам, история которых оборвалась недавно – в начале XXI века и причины этого остаются неясными. Команда российских ученых сделала первый шаг к пониманию причин вымирания тонкоклювого кроншнепа, определив полную последовательность её митохондриального генома (небольшая, кольцевая молекула ДНК, находящаяся в митохондриях, органеллах эукариотических клеток – примечание автора). Было показано, что порядок генов (их локализация) и последовательность ДНК у этого организма ничем не отличается от прочих кроншнепов, ожидаемо приближая её к другим представителям семейства бекасовые – дальневосточному и большому кроншнепам, которые хоть и испытали всю прелесть антропогенного воздействия, но до сих пор встречаются в природе.

 Карта митохондриального генома тонкоклювого кроншнепа. Модифицированная иллюстрация Henrik Grönvold 

Статья, опубликованная в начале апреля в журнале Mitochondrial DNA, описывает структурные особенности митохондриального генома тонкоклювого кроншнепа, однако при всём при этом является во многом «ресурсной».  Предполагается, что дальнейшие исследования изменчивости митохондриальных и ядерных геномов тонкоклювого кроншнепа из различных точек его некогда обширного ареала позволят описать демографическую историю этого вида и, опираясь на данные палеонтологии, геологии, климатологии и геномики, выяснить время начала сокращения популяции тонкоклювого кроншнепа и возможные причины его.

 Стая тонкоклювых кроншнепов на отдыхе. Иллюстрация: John Gerrard Keulemans

Тонкоклювый (малый) кроншнеп — вид птиц из семейства бекасовых (Scolopacidae), некогда гнездившийся на обширных территориях азиатской части России. Последний раз эту птиц наблюдали в 2001 году на территории Венгрии.

Подробнее с результатами можно познакомиться в работе, опубликованной апреле 2019 года в журнале Mitochondrial DNA Part A: Phylogenetic position of the presumably extinct slender-billed curlew, Numenius tenuirostris